Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med27Q9DB40 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms