Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DA42 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DA42 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DA42 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DA42 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DA42 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DA42 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DA42 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DA42 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9DA42 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9DA42 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9DA42 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DA42 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DA42 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DA42 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DA42 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DA42 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DA42 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DA42 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DA42 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DA42 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DA42 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DA42 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms