Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin37Q9D8N6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms