Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4bQ9D8B3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms