Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AY761184Q9D848 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AY761184Q9D848 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms