Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4ipQ9D7Y9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx4ipQ9D7Y9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx4ipQ9D7Y9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms