Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V2

Lysmd2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd2Q9D7V2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd2Q9D7V2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms