Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn22Q9D7U6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn22Q9D7U6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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