Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl40Q9D783 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl40Q9D783 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl40Q9D783 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms