Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5s1Q9D742 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms