Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc94Q9D6J3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms