Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ShpkQ9D5J6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ShpkQ9D5J6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ShpkQ9D5J6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ShpkQ9D5J6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ShpkQ9D5J6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ShpkQ9D5J6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShpkQ9D5J6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms