Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ccdc7Q9D541 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc7Q9D541 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ccdc7Q9D541 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ccdc7Q9D541 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ccdc7Q9D541 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ccdc7Q9D541 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ccdc7Q9D541 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ccdc7Q9D541 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ccdc7Q9D541 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Ccdc7Q9D541 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7Q9D541 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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