Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam227bQ9D518 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam227bQ9D518 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms