Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931423N10RikQ9D4J9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931423N10RikQ9D4J9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms