Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sgms2Q9D4B1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sgms2Q9D4B1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sgms2Q9D4B1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sgms2Q9D4B1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgms2Q9D4B1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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