Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms