Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms