Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnal2Q9D3R6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms