Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
5430402E10RikQ9D3N5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430402E10RikQ9D3N5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms