Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms