Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R6

Coa3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coa3Q9D2R6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Coa3Q9D2R6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Coa3Q9D2R6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms