Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D2Q3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms