Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Trmt44Q9D2Q2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Trmt44Q9D2Q2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Trmt44Q9D2Q2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Trmt44Q9D2Q2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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