Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc8Q9D2H8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc8Q9D2H8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc8Q9D2H8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Fndc8Q9D2H8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Fndc8Q9D2H8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Fndc8Q9D2H8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Fndc8Q9D2H8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Fndc8Q9D2H8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Fndc8Q9D2H8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Fndc8Q9D2H8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Fndc8Q9D2H8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc8Q9D2H8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc8Q9D2H8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc8Q9D2H8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc8Q9D2H8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc8Q9D2H8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc8Q9D2H8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc8Q9D2H8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc8Q9D2H8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc8Q9D2H8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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