Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef12Q9D2F1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef12Q9D2F1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef12Q9D2F1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms