Protein–RNA interactions for Protein: Q9D253

9330161L09Rik, RIKEN cDNA 9330161L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330161L09RikQ9D253 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
9330161L09RikQ9D253 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
9330161L09RikQ9D253 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms