Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D1F3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D1F3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D1F3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms