Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C9

Rrp7a, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp7aQ9D1C9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp7aQ9D1C9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrp7aQ9D1C9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms