Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Exosc7Q9D0M0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exosc7Q9D0M0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms