Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NkapQ9D0F4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NkapQ9D0F4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NkapQ9D0F4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NkapQ9D0F4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NkapQ9D0F4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NkapQ9D0F4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms