Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shmt2Q9CZN7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms