Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms