Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snf8Q9CZ28 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms