Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssbp2Q9CYZ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms