Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms