Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms