Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms