Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX80

Cygb, Cytoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CygbQ9CX80 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CygbQ9CX80 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CygbQ9CX80 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms