Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RpainQ9CWY9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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