Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms