Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MINDY3Q9CV28 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MINDY3Q9CV28 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms