Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nrxn1Q9CS84 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrxn1Q9CS84 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms