Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CRC3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms