Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc5Q9CRA8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc5Q9CRA8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms