Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms