Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931417E11RikQ9CR05 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms