Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PclafQ9CQX4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms