Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PompQ9CQT5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms