Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl35Q9CQL6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Mrpl35Q9CQL6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Mrpl35Q9CQL6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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